烧杯搅拌试验是为确定阳离子聚丙烯酰胺最佳投放剂量使用最多的一种方法。这种方法包括快速搅拌、慢速搅拌和静止沉降三个步骤。投入的阳离子聚丙烯酰胺经快速搅拌迅速分散并水样中的胶粒相接触，胶粒开始凝聚并产生微絮体;通过慢速搅拌，微絮体进一步互相接触长成较大的颗粒;停止搅拌后，形成的胶粒聚集体依靠重力自然沉降置烧杯底部。上述过程常常发生在最佳投放剂量及其附近范围;如果投放剂量不在最佳剂量附近，则曾经上述步骤，胶粒可能仍悬浮在水中。因而，通过测定水样在烧杯搅拌试验后的浊度(或用分光光度计测量吸光度)，即可得知胶体脱稳聚沉的程度，并可由此判断阳离子聚丙烯酰胺的最佳投放剂量。
目前烧杯搅拌实验在具体试验方法上还不统一，这种情况对水和废水处理生产实际没有很大影响。因为由烧杯搅拌试验获得的阳离子聚丙烯酰胺最佳剂量还要通过现场试验进行校正，已得知生产中的最佳剂量。但是这种不统一的试验方法对混凝研究工作有不利影响，造成试验结果之间缺乏可比性。
例如：由于阳离子聚丙烯酰胺最佳剂量的确定与水样PH有关，因而不统一的pH调控及定义的方法会引起最佳剂量比较上的困难。又如，搅拌试验中搅拌器叶片的大小及形状、搅拌的速度与时间、烧杯的形状及尺寸。以及烧杯内是否设置缓冲板等，在不同的文献中常常不同，造成搅拌实验中流速梯度的不同。根据同乡混凝的理论，均匀球状胶粒在凝聚中随时间减少的速率与烧杯中流体的流速梯度成正比。流速梯度相同的搅拌实验，若其他条件相同，即能产生相同的凝聚作用，反之，则不能产生相同的凝聚作用。因而，由具有不同物理特性的搅拌试验所获得的阳离子聚丙烯酰胺最佳剂量就无法互相印证与比较。
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