利用药剂处理污水的过程，就是将污水中污染物与水分离的过程。污水中的污染物颗粒表面大数都带有一定性质的电荷，这些带同种电荷的污染物颗粒相互排斥，使其分布在水中，或者与水以氢键或化学键结合，分布于水中，造成水体的污染。
聚丙烯酰胺有机高分子的分子链，对这些污染物具有强烈的吸附作用，其支链上的相反电荷不仅可以中和带电污染物颗粒表面的电荷，还通过电荷的吸附作用，将污水中的污染物颗粒吸附在其高分子长链上，达到固液分离的目的;聚丙烯酰胺有机高分子长链上的化学基团也会取代污染物与水的氢键及化学键的结合，是污染物与水产生分离，达到净化水的目的。
一般的污水，经过絮凝剂处理后，COD的除去率可达到60~90%以上，而且除去的是很难生化处理的大分子物质，大大的降低了后面生化处理的负荷。
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